5 мая 2023 г. исполнилось 100 лет со дня присвоения Институту имени Пастера.
5 мая 1923 года на основании ходатайства Губздравотдела Президиумом Петрогубисполкома Петроградскому Бактериологическому Институту присвоено имя Пастера (в ознаменование 100-летия со дня рождения выдающегося французского учёного Луи Пастера).
Следует отметить, что в истории международных отношений такое событие как «присвоение» Институту имени Луи Пастера получило известность как «дипломатический казус», поскольку между нашей страной и Францией тогда не было дипломатических отношений (это произошло немного спустя – 28 октября 1924 г.).
Вопросы юридического плана были урегулированы лишь в 1993 г., когда по решению юридического наследника Пастера – Административного совета Парижского Института Пастера – право носить имя великого учёного было предоставлено Санкт-Петербургскому Институту. С этого времени Санкт-Петербургский НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера входит в Международную Сеть Институтов Пастера, включающую в себя 33 института, расположенных на пяти континентах в 26 странах мира.
Если не считать ГИНЗ имени Пастера (Государственный Институт народного здравоохранения – объединение восьми московских институтов, просуществовавшее 10 лет и расформированное в 1930-х гг.), Санкт-Петербургский Институт является единственным научным учреждением на территории бывшего Советского Cоюза и стран СНГ, носящим имя Пастера.