1923 г. приказом Петроградского Губернского отдела здравоохранения Вторая Городская бактериологическая лаборатория (ранее Санкт-Петербургский Частный Бактериологический и Диагностический Институт, руководимый профессорами Белоновским Георгием Дмитриевичем, Либерманом Яковом Юльевичем и Маслаковцом Петром Петровичем) была преобразована в Петроградский Бактериологический и Диагностический Институт.
Первым директором Института был назначен доктор Я.Ю. Либерман. Эпидемиологическое направление в работе Института курировали доктор медицины Маслаковец П.П. и профессор Беседин Георгий Иванович.
В 1924 г. Институту было предоставлено двухэтажное здание на ул. Мира, 12-а (бывший особняк Д.Е. Гордеева, возведенный в 1882-1883 гг. по проекту архитектора В.Ф. Харламова; позже принадлежал графу Владимиру Анатольевичу Орлову-Давыдову).
В 1980-е гг. на этом же месте было возведено новое здание, в котором Институт продолжает свою работу и в настоящее время.